O Colégio Mercedário São José, é um Colégio confessionalmente católico, tendo por isso, uma preocupação com a formação e preparação intelectual abrangente, onde os princípios religiosos estarão presentes, neste processo educativo.
Educar é construir um ser forte, capaz de agir como pessoa e como ser social. Para isso é preciso formar e informar o aluno para que ele alcance um amadurecimento pleno capaz de contribuir na sua auto estima. Reconhecendo a escola como instituição fundamental no processo de integração do aluno a sociedade. O colégio fundamenta sua filosofia educacional nos valores da sociedade e na importância do conhecimento da matéria, que serve como alavanca para projetar o aluno nos momentos decisivos que irá participar em sua caminhada, além de proporcionar a cada um as condições necessárias para a continuidade e o bom desempenho nos estudos dentro das séries.